| Rev |
Age |
Author |
Path |
Log message |
Diff |
| 772 |
3991 d 23 h |
delphine |
/trunk/scripts/modules/chorodep/ |
mise à jour chorodep |
|
| 771 |
3991 d 23 h |
delphine |
/trunk/scripts/modules/chorodep/ |
mise à jour chorodep |
|
| 770 |
3997 d 20 h |
raphael |
/trunk/services/modules/0.1/bdtfx/ |
bdtfx/taxons: tentative manquée d'amélioration de l'API: retourner le nom_retenu_complet, sans faire appel aux ontologies (ie: retour.format=min), utile pour la détermination du Cel |
|
| 769 |
3997 d 22 h |
raphael |
/trunk/scripts/modules/cel/ |
cel/scripts: quelques cleanups supplémentaires (backslashes et nom_sel NULL) |
|
| 768 |
3998 d 0 h |
raphael |
/trunk/services/modules/0.1/ |
ontologies/sptb: correction de notices + traçage des requête mysql + compat PHP-5.2 |
|
| 767 |
3998 d 2 h |
raphael |
/trunk/services/modules/0.1/ |
services: ajout de debug aux requêtes SQL + correction d'un masque pour le service de noms bdtxa |
|
| 766 |
4004 d 3 h |
raphael |
/trunk/services/modules/0.1/baseveg/syntaxons/ |
syntaxon: fix d'une notice, Commun->traiterResultat() attend 2 arguments |
|
| 765 |
4004 d 3 h |
raphael |
/trunk/services/modules/0.1/ |
ontologies: follow-up r759 et r762: utilisation de Bdd::MODE_OBJET pour le fetch PDO [dépend de la r429 du Framework] |
|
| 764 |
4004 d 3 h |
raphael |
/trunk/services/modules/0.1/baseflor/ |
ontologies: suppression de l'appel au webservice des ontologies baseflor (InformationsBaseflor) par une requête SQL directe hyper-simplifiée [dépend de la r429 du Framework] |
|
| 763 |
4004 d 4 h |
raphael |
/trunk/services/modules/0.1/baseflor/ |
ontologies: suppression de l'appel au webservice des ontologies baseflor (CommunGraphiques) par une requête SQL directe hyper-simplifiée [dépend de la r429 du Framework] |
|
| 762 |
4004 d 5 h |
raphael |
/trunk/services/modules/0.1/baseflor/ |
ontologies: suppression de l'appel au webservice des ontologies baseflor (InformationsTaxonsSup) par une requête SQL directe hyper-simplifiée |
|
| 761 |
4004 d 6 h |
raphael |
/trunk/services/modules/0.1/baseflor/ |
baseflor: gestion d'erreur: reformulations/typo mineures |
|
| 760 |
4004 d 20 h |
raphael |
/trunk/scripts/modules/cel/ |
cel/scripts: fixes + intégration complète de "cel_references" (isfan + num_tax = 0) + utilisation de bdtfx v1.01 |
|
| 759 |
4004 d 21 h |
raphael |
/trunk/services/modules/0.1/bdtfx/ |
ontologies: suppression de l'appel au webservice des ontologies "communes" par une requête SQL directe hyper-simplifiée |
|
| 758 |
4005 d 21 h |
raphael |
/trunk/services/modules/0.1/commun/ |
ontologies communes: correction de 2 notices PHP dans le cas de l'absence de passage de
masque et de retour_champs.
Ex: /service:eflore:0.1/bdnt/ontologies/rangTaxo:220/nom |
|
| 757 |
4005 d 23 h |
raphael |
/trunk/scripts/modules/bdtfx/ |
bdtfx/scripts: intégration des données: utilisation de 2 passes pour la détermination des
familles.
Le niveau de récursivité num_tax_sup => num_nom ne permet pas d'obtenir systématiquement la famille d'un
taxon de niveau supérieur en 1 seule requête.
Exemple: Viola riviniana 'Purpurea' (72474) dont le parent (72473) a un num_tax_sup = 87392.
Ce parent apparaît *après* dans le SELECT, la famille de 72474 n'était donc jamais générée.
Pour résoudre ceci, trois passes sont effectuées, mais la solution idéale devrait dépendre de procédure stockées
récursive par soucis de robustesse et d'efficacité.
Familles introuvables: avant 120, après: 68. |
|
| 756 |
4008 d 21 h |
raphael |
/trunk/scripts/modules/cel/ |
cel: scripts, procédure de mise à jour du référentiel pour les observations disposant d'un nom_sel_nn valide et non-conflictuel bdtfx/bdtxa |
|
| 755 |
4008 d 22 h |
raphael |
/trunk/scripts/modules/cel/ |
cel: scripts, renommage, README, clarification sur l'ordre d'usage |
|
| 754 |
4009 d 0 h |
raphael |
/trunk/scripts/modules/cel/ |
cel: scripts, ajout de scripts de mise à jour du schéma et des données.
(les modifications de schéma effectuées par maj-struct-201307.sql
correspondent au à la r1739 dans le dépôt de cel/) |
|
| 753 |
4009 d 20 h |
raphael |
/trunk/scripts/modules/cel/ |
cel: table cel_reference, typo dans la définition d'INDEX |
|
| 752 |
4009 d 20 h |
raphael |
/trunk/scripts/modules/cel/ |
cel: ajout de scripts de MAJ/cleanups de cel_obs: version initiale du Referonosaure et version initiale du Redempteur |
|
| 751 |
4011 d 4 h |
alex |
/trunk/services/modules/0.1/moissonnage/cartes/ |
Correction bug sur requete SQL |
|
| 750 |
4011 d 4 h |
alex |
/trunk/services/modules/0.1/moissonnage/cartes/ |
|
|
| 749 |
4011 d 4 h |
alex |
/trunk/services/configurations/ |
|
|
| 748 |
4011 d 4 h |
alex |
/trunk/services/presentations/images/cartes/ |
Mise a jour de la ressource SVG contenant le fond cartographique de la France pour le web service d'eflore de moissonnage |
|
| 747 |
4011 d 4 h |
alex |
/trunk/services/modules/0.1/moissonnage/ |
Mise à jour du web service de moissonnage generant les cartes SVG de repartition des observations pour e-Flore.
Ajout de commentaires dans les classes |
|
| 746 |
4011 d 22 h |
alex |
/trunk/services/configurations/ |
Correction du parametre projetsDispo |
|
| 745 |
4011 d 22 h |
alex |
/trunk/services/configurations/ |
Mise à jour des fichiers de configuration pour les web services nasa-srtm et moissonnage |
|
| 744 |
4011 d 22 h |
alex |
/trunk/services/presentations/ |
Suppression donnees SRTM de la NASA |
|
| 743 |
4011 d 22 h |
alex |
/trunk/services/modules/0.1/nasa-srtm/ |
Mise à jour de la classe altitude : correction des paramètres acceptés par le web service et ajout d'un cartouche de commentaire en début de code. |
|
| 742 |
4011 d 23 h |
alex |
/trunk/services/modules/0.1/ |
Renommage service altitude. Le nouveau nom du web service est maintenant nasa-srtm (pour être plus en adéquation avec les ressources utilisées que sont les fichiers HGT du modèle SRTM de la NASA) |
|
| 741 |
4012 d 1 h |
raphael |
/trunk/scripts/modules/cel/ |
cel: scripts, ajout de champs baseflor/baseveg à l'intégration dans cel_references
et déplacement des notes et commentaires annexes dans le fichier "A_LIRE" |
|
| 740 |
4015 d 23 h |
raphael |
/trunk/services/modules/0.1/bdtfx/ |
service noms: debug ajout de __FILE__ comme commentaire suffixé aux requêtes
afin de faciliter l'identification des appels en cas d'activation du general_log MySQL. |
|
| 739 |
4016 d 1 h |
raphael |
/trunk/scripts/modules/cel/ |
cel: scripts, transformation du SQL en SH pour permettre un choix de nom de base/table facilité |
|
| 738 |
4016 d 2 h |
raphael |
/trunk/scripts/modules/cel/ |
cel: amélioration du script de génération de `cel_references` |
|
| 737 |
4016 d 21 h |
raphael |
/trunk/scripts/modules/cel/ |
cel: version initiale du script de génération de `cel_references` |
|
| 736 |
4018 d 5 h |
alex |
/trunk/services/ |
Ajout d'un nouveau web service altitude qui calcule l'altitude pour un point dont on passe les coordonnees longitude/latitude dans les parametres de l'URL.
Dans le dossier présentations, ajout d'un dossier SRTM contenant les fichiers MNT par secteurs de 1*1 degré, décrivant l'altitude d'échantillons de points situés tous les 90 m |
|
| 735 |
4025 d 3 h |
alex |
/trunk/services/modules/0.1/moissonnage/cartes/ |
Correction bug sur les requêtes de récupération des stations pour un genre donné |
|
| 734 |
4030 d 0 h |
raphael |
/trunk/services/modules/0.1/nvjfl/ |
nom-vernaculaires: support de requêtes multi-critères pour NVJFL, côté client: ACTIVATION
Ce commit active la recherche d'ontologie par multi-critères
pour le web-service de nom vernaculaire JFL.
Un define(), nécessaire mais malheureusement précédemment omis, a été rajouté. |
|
| 733 |
4030 d 0 h |
raphael |
/trunk/services/modules/0.1/commun/ |
ontologies: support de requêtes multi-critères pour les ontologies (partie 2/2).
Lorsque des ontologies sont demandées, celles-ci peuvent désormais être regroupées
au sein d'une même requête.
La modification, portée à Commun/Ontologie.php affecte donc les web-services n'ayant *pas*
redéfini leur classe d'accès aux ontologies, c'est à dire (au 28/06/2013):
* nvjfl
* bdnt
Exemple:
Avant, 3 requêtes:
/service:eflore:0.1/nvjfl/ontologies/numStatut:1
/service:eflore:0.1/nvjfl/ontologies/numStatut:2
/service:eflore:0.1/nvjfl/ontologies/genreNombre:10
Après, 1 requête:
/service:eflore:0.1/nvjfl/ontologies/numStatus:1,numStatus:2,genreNombre:10
Dans le seul cas d'une requête multi-critères le format de retour du web-service
a été modifié: Un ensemble de clef-valeurs est retourné dans lequel chaque clef
représente le nom d'un des critères demandés.
Si un critère ne correspond à rien dans la BDD, celui-ci est absent de l'ensemble retourné.
$ ddiff \
<(GET "http://eflore/$i"|json_pp) \
<(GET "http://www.tela-botanica.org/$i"|json_pp)
# service:eflore:0.1/nvjfl/noms-vernaculaires/attributions?masque.nt=1382&masque.lg=fra&retour.champs=conseil_emploi
# 2 appels d'ontologies nvjfl, résultat identique
# service:eflore:0.1/bdtxa/taxons/13517/relations/inferieurs
# 1 appel d'ontologie bdnt/nom, résultat identique
$ diff \
<(GET http://eflore/service:eflore:0.1/bdnt/ontologies/rangTaxo:70|json_pp) \
<(GET http://eflore/service:eflore:0.1/bdnt/ontologies/rangTaxo:70,rangTaxo:-1|json_pp) \
|grep -v rangTaxo:70
# même résultat (-1 n'existe pas)
Le comparatif suivant provient de l'étude de la requête suivante,
représentative d'une recherche de nom commun (cf: Cel/export XLS):
"/service:eflore:0.1/nvjfl/noms-vernaculaires/attributions?masque.nt=1382&masque.lg=fra&retour.champs=conseil_emploi"
Avant Après
Requêtes HTTP 3 2
Connexions SQL 4 3
SELECT 15 10
Temps sur 300 (*) 1m36 1m30
(*) $ time \
mysql -N tb_eflore<<<"SELECT num_taxonomique FROM bdtfx_v1_01 WHERE num_nom = num_nom_retenu ORDER BY ORD(SUBSTRING(nom_sci, 4, 1)) LIMIT 300;" | \
xargs -i -t -n 1 curl -so /dev/null "http://eflore/service:eflore:0.1/nvjfl/noms-vernaculaires/attributions?masque.nt={}&masque.lg=fra&retour.champs=conseil_emploi";
Le faible différentiel de temps observable s'explique partiellement par le fait que toutes les recherches de nom vernaculaire
n'aboutissent pas systématiquement à l'émission de plusieurs requêtes d'ontologie.
Le différentiel n'en reste pas moins décevant. |
|